藥物流產次數過多或流產過程中出現併發症，可引起女性不育。
藥物流產時脫膜從宮腔內排出需要較長時間，陰道出血時間增加感染機會，脫膜留在宮腔內增加組織碎屑堵塞輸卵管的機會，很多輸卵管感染患者沒有明顯症狀，盆腔檢查也很大一切正常，導致輸卵管慢性炎症堵塞不孕。
藥物流產後，子宮刮除物進行組織學檢查，80%伴有不同程度的炎症細胞浸潤，提示子宮出血時間長，可能誘發子宮內膜炎。藥流後繼發不孕的主要原因是輸卵管梗阻。
藥物流產後發炎的主要原因是藥物流產後陰道出血時間過長或組織殘留宮腔感染的藥物流產前生殖道發炎，特別是支原體、衣原體感染，非臨牀或隱蔽感染，無法儘快診治，感染持續
清官術生殖道損傷，加上宮頸 黏液栓的消失，刮宮後機體抵抗力下降，從而使病菌入侵或陰道內非特異性菌羣平衡失調，引起感染，導致輸卵管黏膜的炎症或周圍瘢痕組織的牽拉屈曲改道或閉塞，表現爲輸卵管通暢障礙，使卵子與精子無法會合而引起不孕。
