如果齲齒深，傷及神經，那麼補牙的時候痛感就會比較強烈。而淺層齲齒補牙痛感輕，甚至不會痛。
如果需要補的牙洞較淺的話，那麼補牙是不會感到疼痛的。如果牙洞很深，爛到牙神經，可能會痛了。大夫治療時會先將孩子齲壞牙齒中的腐質清理乾淨，再進行補牙，而去除腐質時器械碰觸到牙本質會有疼痛的感覺。一般口腔大夫手法都較輕柔，不會太過疼痛。
過於簡單的淺齲和中齲，需要去除窩洞內的腐質製備成一定的洞形以充填，在去腐過程中因爲觸及到牙本質層會感到不同程度的敏感。
對於深齲患者，因爲窩洞比較深已接近牙髓，去除腐質時疼痛的感會比較明顯，但是爲了判斷牙髓活力和是否有穿髓點，一般不建議給患者注射麻藥。
如果齲壞已經到達牙髓引起了牙髓炎，這時疼痛會更明顯，不過此時如已確定穿髓。醫生會爲患者適當注射局部麻醉藥物的。
補牙，到正規醫院，進行正規的操作，是可以最大限度的避免疼痛的，而且效果也比較好。因此，補牙務必要選擇正規的醫院進行。
