早上起牀渾身疼首先可能是睡覺姿勢不正確、白天過多勞動等生理因素所致，無需治療。其次，也可能是流行性感冒、類風溼性關節炎等引起的，需要採取藥物治療、手術治療。
晚上睡覺時長時間維持一個姿勢，而且睡覺時牀墊比較軟或硬，可能會出現早上起牀渾身疼的表現。另外，白天進行重體力勞動會使體內出現乳酸堆積，也會引起早上起牀渾身疼的症狀。這屬於正常生理表現，可以不進行治療，一般在休息或調整睡覺姿勢後會緩解。
流行性感冒主要是流感病毒感染引起的，患者會出現高熱、畏寒、頭痛、全身肌肉關節痠痛、咽喉疼痛、流鼻涕等表現，所以患者會出現早上起牀後出現渾身疼的症狀。建議患者監測體溫，及時就醫，可以在患病後48小時內遵醫囑用奧司他韋、帕拉米韋等抗病毒藥。對於出現高熱的患者則需要遵醫囑用布洛芬、對乙酰氨基酚等解熱鎮痛藥。
類風溼性關節炎、骨質疏鬆症、系統性紅斑狼瘡等風溼免疫性疾病患者會出現全身多關節疼痛、腫脹、晨僵、發熱等表現，從而患者會表現爲早上起牀渾身疼。患者可以遵醫囑用甲氨蝶呤、來氟米特等抗風溼藥，以及洛索洛芬、雙氯芬酸鈉等非甾體消炎藥，必要時使用糖皮質激素。
如果排除生理因素引起的早上起牀渾身疼，患者需要及時就醫，遵醫囑治療。
