要確診肛裂，首先要詢問排糞疼痛史，有典型的疼痛間歇期和疼痛週期，即不難診斷。局部檢查發現肛管後正中部位的肛裂“三聯徵”，則診斷明確。但在肛裂早期，需與肛管皮膚探傷相鑑別已確診肛裂時，一般不宜做直腸指診及肛門鏡檢查，以免引起劇痛。對側位的慢性潰瘍，要想到有否結核、癌、克隆病及潰瘍性結腸炎等罕見病變，必要時應行活組織病理檢查。
鑑別診斷
須與結核性潰瘍，梅毒潰瘍，軟下疳和上皮癌等潰瘍相鑑別，其中潰瘍性結腸炎和肉芽腫性結腸炎併發之肛裂極易鑑別。
1、肛門皮膚擦傷
肛裂早期需與肛門皮膚擦傷相鑑別。
2、腸道炎性疾病
某些腸道炎性疾病可伴有肛門周圍的潰瘍，診斷時應注意鑑別，
①肛管結核潰瘍。
②克羅恩病肛管潰瘍。
③梅毒潰瘍。
④潰瘍性結腸炎併發的肛裂。
