川崎病對人體的影響並非外在表現，而上對心臟等內部器官可能會造成不可逆的損害。如果沒有及時治療，川崎病可能會引發其他各種疾病，需要引起重視及早治療。
1、川崎病可能會引發冠狀動脈病變，有部分患者在發病第三天就會出現冠狀動脈擴張的情況，一般來說3-6個月內會消退，如果情況嚴重可能會出現冠狀動脈瘤，會對心臟造成損害。
2、在川崎病急性發病期可能會使神經系統發生改變，從而出現急性腦病、聽力喪失、面部神經麻痹、無菌性腦脊髓膜炎等。這些都是由於血管炎引起的常見疾病，不過父母不用過於擔心，這些一般恢復會比較快。無菌性腦脊髓膜炎較爲常見，一般在發病前兩週出現，患者可能會出現嗜睡、昏迷等意識障礙，但一般會在幾日內消失。
3、在急性期或者亞急性期，可能會有關節炎或者關節痛的現象出現，但這種情況也會隨着病情的好轉而恢復。
