（一）與陳舊性宮外孕 臨牀表現有腹痛，月經異常，盆腔檢查於一側可觸及腫塊等易與慢性輸卵管炎混淆。但是，陳舊性異位妊娠有停止經歷，突然出現下腹部疼痛、噁心、頭暈等內出血症狀，疼痛可以自己緩解，之後多次突然發作，下腹部出現腫塊，伴有少量出血。患者呈貧血狀態。婦科檢查時，腫塊往往偏向於一側，質地實用，有彈性，形狀極不規則，壓痛輕於炎症。通過後穹孔穿刺可以吸收舊血液和小血塊。
(2)子宮內膜異位症有痛經、月經多、性交痛、排便痛、不孕、骨盆腫塊粘連等體徵，容易混合。慢性輸卵管炎診斷子宮內膜異位症患者無急性感染病史，經各種消炎治療無效。其痛經特點爲繼發性、進行性加重，經前開始，經期劇烈並持續至經後數日。婦科檢查則盆腔中有明顯的粘連，子宮均勻性增大，並固定於後傾後屈的位置，子宮直腸窩處，特別是子宮骶骨韌帶有不規則硬結節及觸痛。必要時可用藥物試驗治療。
(3)與雙子宮腺肌病有痛經，檢查時容易混合骨盆腫塊。但是，雙子宮腺肌病、腹痛規律與單子宮相同，仔細檢查可以接觸兩個腫塊，形狀與子宮相似。子宮碘油造影可發現畸形子宮。
（四）與卵巢囊腫 腫瘤爲囊性，位於下腹一側，腫塊以外可捫到子宮體，故與輸卵管積水難以鑑別。但卵巢囊腫無炎症病史。婦科檢查時腫瘤呈圓形或橢圓形較多，表面光滑且活動。典型的輸卵管積水呈腸狀，腫塊周圍有粘連，一般囊壁薄。輸卵管積水大或扭轉時，兩種疾病難以識別。只有在手術中才能確診。
(5)與慢性闌尾炎大多數慢性闌尾炎患者沒有典型的急性闌尾炎發作史，只訴說右下腹痛和胃腸功能障礙症狀，陽性體徵也不明顯，需要與慢性輸卵管炎的區別。X線鋇餐檢查可有一定幫助。闌尾不能顯示時，盲腸內側有限的壓痛，壓痛部位隨盲腸位置的變化而移動。婦科檢查子宮和附件無異常。
(6)和輸卵管結核表現月經失調、腰痛、下腹隱痛、不育等症狀。但而，輸卵管結核患者往往沒有急性炎症病史。往往於生殖器以外臟器如肺、腸、腹膜等有結核病竈存在。月經失調多見閉經表現。子宮內膜活體組織檢查，大部分可以發現結核病竈。血沉快、胸部透視、胃腸與盆腔X線攝片以及子宮一輸卵管碘油造影可幫助診斷。
（七）與卵巢冠囊腫 於盆腔觸及囊性腫塊則應與輸卵管積水鑑別，一般說鑑別較爲困難。但卵巢冠囊腫無炎症病史。婦科檢查腫塊呈圓形囊感明顯，活動，無粘連。
