一些特殊生理狀況的嬰兒，需要食用經過特別加工處理的嬰兒配方食品。此類嬰兒配方食品，需經醫師、營養師指示後，纔可食用，依其成分特性又可進一步分爲五種不同的配方奶粉，分別是不含乳糖之嬰兒配方奶、部份水解奶粉、完全水解奶粉、元素配方奶粉和早產兒配方奶粉。每種奶粉都針對不同體質、不同年齡的寶寶們。
1、不含乳糖之嬰兒配方奶：適用於對乳糖無法耐受的嬰兒。可分爲：以牛乳爲基礎之無乳糖嬰兒配方奶，以及以黃豆爲基礎之無乳糖嬰兒配方奶粉。
2、部份水解奶粉：適用於較輕度的腹瀉或過敏之嬰兒。
3、完全水解奶粉：適用於過敏或短腸症候羣之嬰兒。
4、元素配方奶粉：適用於最嚴重的慢性腹瀉、過敏或短腸症候羣之嬰兒。
5、早產兒配方奶粉：適合早產兒使用。
