新生嬰兒腦積水造成的緣故多見大腦皮質導水管狹小畸型。與此同時也有多種多樣緣故，例如：
（1）發育畸形：較多見的是脊柱裂，人的大腦導水管畸型或腦血管瘤等。先天的病症許多是沒法防止的，只能依靠後天性醫治，看是不是可以醫好。
（2）感柒：如生膿性腦膜炎或結核性腦膜炎無法儘早適度地醫治，增生的結締組織堵塞了腦脊液循環孔洞，尤其是第四腦室孔及腦底端的蛛網膜下腔的黏連。
（3）流血：腦出血後的化學纖維增生可造成腦積水。
（4）惡性腫瘤：腦部腫瘤可堵塞腦脊液循環的任一部分，常見於第四腦室周邊。
（5）維生素D欠缺也能致腦組織容積提升，進而造成顱壓高的病症。
（6）出世時是不是孕婦難產，氧氣不足等。
