淋菌感染的潛伏期爲1-14天不等，新生兒淋菌結膜炎一般在出生後1-2周內發病，症狀有雙眼眼瞼腫脹，結膜發紅，睫毛粘在一起，睜眼時有膿性分泌物，局部加壓有膿液溢出等。如果不能夠及時治療，結膜炎惡化，會引起淋菌眶蜂窩織炎，也可浸潤角膜形成角膜潰瘍、雲翳，甚至導致失明。
妊娠合併淋病會導致感染性流產與人工流產後感染。妊娠晚期的時候孕婦還會因爲淋菌性宮頸管炎而發生胎膜早破，也就是羊水穿了。胎膜早破的話，孕婦會出現羊膜腔感染綜合徵，分娩時出現滯產。胎兒會因此早產或者胎兒宮內感染。資料顯示，妊娠合併淋病患者早產發病率約爲17%，胎兒感染易發生胎兒窘迫、胎兒宮內發育遲緩，甚至導致死胎、死產。
另外，妊娠合併淋病患者產後經常會發生產褥感染。如果胎兒能夠經陰道生出，還可能會發生新生兒淋菌結膜炎、肺炎等，甚至出現淋菌敗血症，使新生兒死亡了增加。
