在保存芝麻醬的時候，在芝麻醬的表層淋一層香油，將空氣與芝麻醬隔離，能夠保證芝麻醬在有效期內不會變質。
如果是稀釋了的芝麻醬，最好是先用微波爐將芝麻醬中的水分烘乾，再放入冰箱中冷藏，就能夠保存到下次食用了。
還需要注意不要如果是將芝麻醬放在廚房的話，不要放得離竈臺太近，避免竈臺溫度過高導致芝麻醬變質。
如果是拆封的芝麻醬，最好是冷藏保存，避免脂肪氧化導致芝麻醬發生腐敗現象。
而如果在保存期間需要食用芝麻醬，則必須要用乾淨的餐具取適量，然後繼續密封好並冷藏。
如果需要長期儲存芝麻醬，就需要在芝麻醬裏添加一些防腐劑，可延長存儲時間。
