醉河蟹雖然是一道經典菜式，但是它卻並不健康，因爲河蟹原本就是一種比較“危險”的食材，它生活在髒污的泥溝中，以動物屍體爲食，在身體內積累了大量的細菌和毒素，只是因爲河蟹的免疫力強大而沒有危害自身的健康，但是在它的鰓、沙包、內臟中都隱藏了大量的細菌，醉河蟹沒有經過高溫烹煮，這些細菌是無法分解的，進入人體會產生危害，影響健康，嚴重的甚至會造成食物中毒。
醉河蟹性寒，脾胃虛寒的人吃會造成不適，而大量食用也會出現腹瀉等腸道症狀，於健康不利。
除了這些以外，一些疾病人士吃醉蟹還會加重病情，患有傷風、發熱胃痛以及腹瀉的病人，消化道炎症或潰瘍膽囊炎、膽結石症、肝炎活動期的人都不宜吃醉蟹，而患有冠心病、高血壓、動脈硬化、高血脂的人也要少吃蟹黃，體質過敏的人和孕婦都要對醉蟹敬而遠之。
