黃體酮對女性的功效有很多，主要還是治療經前期綜合徵、流產等。首先黃體酮在月經週期後期使子宮粘膜內腺體生長，子宮充血，內膜增厚，爲受精卵植入作好準備。受精卵植入後則使之產生胎盤，並減少妊娠子宮的興奮性，抑制其活動，使胎兒安全生長。研究還認爲孕酮可以改變子宮細胞膜對離子的通透性，使膜處於超級化狀態，因而降低了子宮肌興奮性和傳導性，並降低了子宮肌對刺激的敏感性，起到保胎作用。
另外，黃體酮有免疫保護、抑制免疫反應的作用。女性在正常妊娠時，孕酮增加，能防止胚胎被母體排斥而維持妊娠。孕酮不足時，可能使胚胎被母體排斥而流產。黃體酮與雌激素共同作用下，促使乳房充分發育，可以爲產乳作準備。
黃體酮還會使女性子宮頸口閉合，粘液減少變稠，使精子不易穿透；大劑量時通過對下丘腦的負反饋作用，抑制垂體促性腺激素的分泌，產生抑制排卵作用。
