土茯苓煲龜是一清一補的上好食療養生品，副作用幾乎沒有，只是小部分人不適宜食用，而且在食用時要注意一些搭配禁忌。
1、肝腎陰虧者慎服。據河南鶴壁市中醫院報道1例因皮膚病服含土茯苓的中藥後致過敏，周身皮膚瘙癢，並起散在性大小紅斑丘疹。原方去土茯苓後不發生過敏症狀，如再加土茯苓則過敏症狀又出現。
2、孕婦慎食。土茯苓煲龜湯，廣東人認爲是去溼解毒最有效的湯。然而茯苓中含多聚糖類以及麥角固醇、蛋白酶、脂肪酸等，可引起過敏反應，偶爾可令人出現皮膚紅腫、丘疹、風團、支氣管哮喘、腹痛等。
3、龜肉不宜與酒、果、瓜、豬肉、莧菜同食。輕傷元氣，重則傷亡。莧菜含有大量去甲基腎上腺素，多量鉀鹽和一定量的二羥乙胺，其中的 二羥乙胺與甲魚肉是相剋的。因爲二羥乙胺具有使得血小板聚集的作用。甲魚肉質滋膩，如果與二羥乙胺相遇會導致損害胃，消化不良，由此， 使得消化功能減退。
4、龜肉忌薄荷，食則患疝氣病。
5、龜肉忌冬筍，食則中毒。
