牡蠣粉雖然功效衆多，但是幹吃需要在醫生指導下用藥，以免產生不良的的反應，不利於牡蠣粉發揮藥效以及身體的恢復。通常情況下牡蠣粉可以用酒、溫水、湯等送服。
1、心脾氣痛，有痰。用牡蠣煅成粉，酒送服二錢。
2、瘧疾寒熱。用牡蠣粉、杜仲，等分爲末，加蜜做成丸子，如梧子大。每服五十丸，溫水送下。
3、氣虛盜汗。用牡蠣粉、杜仲，等分爲末。每服一匙，酒送下。
4、產後盜汗。用牡蠣粉、麥麩（炒黃）等分。每服一錢，豬肉湯調下。
5、消渴飲水。用黃泥封固牡蠣，煅赤，研爲末。每服一錢，活鯽魚煎湯調下。
除了口服，牡蠣粉也可以同其他的藥物搭配用來外敷治療。
1、陰囊水腫用牡蠣煅粉二兩、乾薑（炮）一兩，共研爲末，冷水調糊敷上。不久，囊熱如火。藥幹即換，至小便通暢末，冷水調糊敷上。不久，囊熱如火。藥幹即換，至小便通暢爲愈。又方：改冷水調糊爲蔥汁，白麪同調。不兒不用幹姜。
2、刀傷出血。用牡蠣粉敷塗。
3、癰腫初起。用牡蠣粉末調水塗搽。藥幹即換。
