泌尿繫結石的病因比較複雜，絕大部分病因是不清楚的。但是人類始終未放棄對該病的研究，從考古學發現證實幾千年前人類就已患泌尿繫結石。
公元130-200年古羅馬著名醫師Galen就提出結石病與遺傳、種族、氣候、飲食、飲水、飲酒、痛風、風溼以及代謝病有關，並認爲痛風石和尿石的性質和來源相同。在中國古代也有許多對結石病的記錄。中醫醫書中的“石淋”指的就是尿石病。雖然古代中、外文獻對結石病均有大量記載，但對結石的形成卻無明顯的研究。
直到近代18、19世紀，隨着生物化學、物理化學的生理學的發展，人們開始注意強調結石的基本病因、成分和類型。十九世紀的英、法醫學人士對泌尿繫結石做了大量研究，明確肯定飲食與尿石的形成有關。到19世紀中提出尿石形成主要依靠一些有機物與其他可沉澱物，認爲：因尿路炎症形成的有機物的膠着或粘基質的作用而形成尿石。
進入20世紀，隨着研究的發展，人們認識到除前人提到的結石原因外，患結石實際上是全身疾病的一個症狀，是全身代謝的紊亂導致。進入現代社會，儘管仍對大多數泌尿繫結石病因不明，但隨着科技的發展，人們在最終將病因分爲代謝紊亂和局部因素上取得了共識，有些泌尿繫結石的病因已能明確診斷，例如：甲狀旁腺機能亢進就是引起尿結石的病因之一。
