抑鬱症治療以藥物爲主，藥物治療的特點是起效相對較快，療效比較確定，適合於中度、重度抑鬱症患者。抗抑鬱藥是當前治療各種抑鬱障礙的主要藥物，能有效解除抑鬱心境及伴隨的焦慮、緊張和軀體症狀，有效率約60%～80%。
1．目前一線的抗抑鬱劑主要爲選擇性5-羥色胺再攝取抑制劑類藥物，如帕羅西汀、舍曲林、氟西汀、西酞普蘭、氟伏沙明等，俗稱“五朵金花”。
2．5-羥色胺和去甲腎上腺素再攝取抑制劑類藥物，如文拉法辛、度洛西汀，此類療效肯定，起效較快，有明顯的抗抑鬱及抗焦慮作用。對難治性病例亦有效。
3．去甲腎上腺和特異性5-羥色胺能抗抑鬱藥，如米氮平，有良好的抗抑鬱、抗焦慮及改善睡眠作用，口服吸收快，起效快，抗膽鹼能作用小，有鎮靜作用，對性功能幾乎沒有影響。
4．三環類及四環類抗抑鬱藥，如丙咪嗪、氯米帕明、阿米替林及多塞平、馬普替林等。
5．單胺氧化酶抑制劑，代表藥物如嗎氯貝胺。
6．其他抗抑鬱藥，如安非他酮，爲去甲腎上腺素、5-羥色胺、多巴胺再攝取的弱抑制劑，對單胺氧化酶沒有抑製作用，適用於抑鬱症以及雙相抑鬱，優勢爲對體重以及性功能影響小。
7．對於一些焦慮明顯、伴有睡眠障礙的患者，可以短期使用一些苯二氮卓類（安定類）藥物或者一些新型的助眠藥物，如唑吡坦、佐匹克隆。對於一些症狀嚴重，甚至伴有精神病性症狀的患者，可以合併抗精神病藥物治療。
